Début de course, pôle position pour Rossi qui vire en tête très rapidement, un accrochage pour Nakano qui est à terre dès les premiers tours. Dans le peloton de tête, nous retrouvons : Rossi suivi de Pedrosa, Edwards puis Hayden. Très vite un second accrochage, cette fois-ci entre Giberneau et Stoner, ce qui nous fait trois pilotes au sol et cela seulement après deux tours de course. En tête, Pedrosa colle Rossi, mais vite dépassé par Edwards qui se retrouve derrière son co-équipier. Se sont donc deux Yamaha qui dirigent la course et mêne un train d’enfer aux autres Honda et Suzuki. Hayden passe Pedrosa, c’est un combat de titans à l’avant.

Rossi n’a que 9 dixièmes d'avance sur Edwards, il signe le meilleur temps. Chute de Pedrosa qui dans sa chute emmène Hayden avec lui, les deux HRC sont au tapis. Hayden est dans une fureur monstre. Le dépassement de Dani était très ou trop osé, ce qui se conclu par l’abandon des deux pilotes qui perdent plus que la course, mais une chance pour Hayden de rester sur la première place du championnat. Elias se rapproche très fortement de Edwards et finit par le dépasser. Suite à cette série de chute, nous avons beaucoup de mouvement en tête, et nous retrouvons Rossi suivi de Elias, Edwards, Roberts et enfin Tamada. Pendant ce temps en fin de course, Mc Coy rentre au stand. Elias fait le forcing sur Rossi, et arrive à le dépasser très facilement mais un tour après Rossi reprend sa place de leader. Mc coy repart, il tient au point de la quinzième place. Roberts double Elias et se retrouve deuxième derrière Rossi. A deux tours de la fin Roberts est en tête de la course, suivi de Rossi et Elias. Au freinage, Elias passe Rossi et Roberts et se retrouve donc premier mais dans la partie lente du circuit Rossi repasse Elias. C’est sur la ligne d'arrivée qu’ils passent pratiquement ensemble mais c'est Elias qui remporte ce grand prix d'Estoril. Ce fut un magnifique Grand Prix, plein de rebondissements. Pour la première fois de la saison Rossi se retrouve en tête du championnat avec 8 points d'avance.
Rendez vous pour le prochain GP et le dernier de la saison, le 29 Octobre à Valence.